Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CHIC2Q9UKJ5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CHIC2Q9UKJ5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CHIC2Q9UKJ5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CHIC2Q9UKJ5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CHIC2Q9UKJ5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CHIC2Q9UKJ5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CHIC2Q9UKJ5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CHIC2Q9UKJ5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CHIC2Q9UKJ5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CHIC2Q9UKJ5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
CHIC2Q9UKJ5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CHIC2Q9UKJ5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CHIC2Q9UKJ5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CHIC2Q9UKJ5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CHIC2Q9UKJ5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CHIC2Q9UKJ5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CHIC2Q9UKJ5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CHIC2Q9UKJ5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CHIC2Q9UKJ5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CHIC2Q9UKJ5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CHIC2Q9UKJ5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CHIC2Q9UKJ5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CHIC2Q9UKJ5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
CHIC2Q9UKJ5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CHIC2Q9UKJ5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CHIC2Q9UKJ5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CHIC2Q9UKJ5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CHIC2Q9UKJ5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CHIC2Q9UKJ5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CHIC2Q9UKJ5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CHIC2Q9UKJ5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CHIC2Q9UKJ5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CHIC2Q9UKJ5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CHIC2Q9UKJ5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CHIC2Q9UKJ5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CHIC2Q9UKJ5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CHIC2Q9UKJ5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CHIC2Q9UKJ5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CHIC2Q9UKJ5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CHIC2Q9UKJ5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CHIC2Q9UKJ5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CHIC2Q9UKJ5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CHIC2Q9UKJ5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CHIC2Q9UKJ5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CHIC2Q9UKJ5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CHIC2Q9UKJ5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CHIC2Q9UKJ5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
CHIC2Q9UKJ5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CHIC2Q9UKJ5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CHIC2Q9UKJ5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CHIC2Q9UKJ5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CHIC2Q9UKJ5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CHIC2Q9UKJ5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CHIC2Q9UKJ5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CHIC2Q9UKJ5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CHIC2Q9UKJ5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CHIC2Q9UKJ5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CHIC2Q9UKJ5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CHIC2Q9UKJ5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CHIC2Q9UKJ5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CHIC2Q9UKJ5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CHIC2Q9UKJ5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CHIC2Q9UKJ5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CHIC2Q9UKJ5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CHIC2Q9UKJ5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CHIC2Q9UKJ5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CHIC2Q9UKJ5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CHIC2Q9UKJ5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CHIC2Q9UKJ5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CHIC2Q9UKJ5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CHIC2Q9UKJ5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CHIC2Q9UKJ5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CHIC2Q9UKJ5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CHIC2Q9UKJ5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CHIC2Q9UKJ5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CHIC2Q9UKJ5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CHIC2Q9UKJ5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CHIC2Q9UKJ5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CHIC2Q9UKJ5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CHIC2Q9UKJ5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CHIC2Q9UKJ5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
CHIC2Q9UKJ5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
CHIC2Q9UKJ5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CHIC2Q9UKJ5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CHIC2Q9UKJ5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
CHIC2Q9UKJ5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CHIC2Q9UKJ5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CHIC2Q9UKJ5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CHIC2Q9UKJ5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CHIC2Q9UKJ5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CHIC2Q9UKJ5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CHIC2Q9UKJ5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CHIC2Q9UKJ5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CHIC2Q9UKJ5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CHIC2Q9UKJ5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CHIC2Q9UKJ5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CHIC2Q9UKJ5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CHIC2Q9UKJ5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CHIC2Q9UKJ5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms