Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
FBXO3Q9UK99 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FBXO3Q9UK99 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FBXO3Q9UK99 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FBXO3Q9UK99 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FBXO3Q9UK99 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FBXO3Q9UK99 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FBXO3Q9UK99 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FBXO3Q9UK99 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FBXO3Q9UK99 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FBXO3Q9UK99 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FBXO3Q9UK99 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FBXO3Q9UK99 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
FBXO3Q9UK99 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FBXO3Q9UK99 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FBXO3Q9UK99 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FBXO3Q9UK99 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FBXO3Q9UK99 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FBXO3Q9UK99 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FBXO3Q9UK99 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
FBXO3Q9UK99 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FBXO3Q9UK99 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FBXO3Q9UK99 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FBXO3Q9UK99 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FBXO3Q9UK99 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FBXO3Q9UK99 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FBXO3Q9UK99 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FBXO3Q9UK99 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FBXO3Q9UK99 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FBXO3Q9UK99 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FBXO3Q9UK99 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FBXO3Q9UK99 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FBXO3Q9UK99 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FBXO3Q9UK99 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FBXO3Q9UK99 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FBXO3Q9UK99 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FBXO3Q9UK99 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms