Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHMP5Q9NZZ3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHMP5Q9NZZ3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHMP5Q9NZZ3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms