Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
FBXO28Q9NVF7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FBXO28Q9NVF7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
FBXO28Q9NVF7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXO28Q9NVF7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXO28Q9NVF7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXO28Q9NVF7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXO28Q9NVF7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FBXO28Q9NVF7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FBXO28Q9NVF7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FBXO28Q9NVF7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FBXO28Q9NVF7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FBXO28Q9NVF7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FBXO28Q9NVF7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FBXO28Q9NVF7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FBXO28Q9NVF7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FBXO28Q9NVF7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FBXO28Q9NVF7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FBXO28Q9NVF7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FBXO28Q9NVF7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FBXO28Q9NVF7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FBXO28Q9NVF7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
FBXO28Q9NVF7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FBXO28Q9NVF7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
FBXO28Q9NVF7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FBXO28Q9NVF7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FBXO28Q9NVF7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FBXO28Q9NVF7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FBXO28Q9NVF7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FBXO28Q9NVF7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FBXO28Q9NVF7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FBXO28Q9NVF7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FBXO28Q9NVF7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FBXO28Q9NVF7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FBXO28Q9NVF7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FBXO28Q9NVF7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FBXO28Q9NVF7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FBXO28Q9NVF7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FBXO28Q9NVF7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FBXO28Q9NVF7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FBXO28Q9NVF7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FBXO28Q9NVF7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FBXO28Q9NVF7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FBXO28Q9NVF7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FBXO28Q9NVF7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FBXO28Q9NVF7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FBXO28Q9NVF7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FBXO28Q9NVF7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FBXO28Q9NVF7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FBXO28Q9NVF7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FBXO28Q9NVF7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FBXO28Q9NVF7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FBXO28Q9NVF7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FBXO28Q9NVF7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FBXO28Q9NVF7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FBXO28Q9NVF7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FBXO28Q9NVF7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FBXO28Q9NVF7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FBXO28Q9NVF7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FBXO28Q9NVF7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FBXO28Q9NVF7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FBXO28Q9NVF7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FBXO28Q9NVF7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FBXO28Q9NVF7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FBXO28Q9NVF7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FBXO28Q9NVF7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
FBXO28Q9NVF7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FBXO28Q9NVF7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FBXO28Q9NVF7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FBXO28Q9NVF7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FBXO28Q9NVF7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FBXO28Q9NVF7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms