Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IMP3Q9NV31 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IMP3Q9NV31 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IMP3Q9NV31 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IMP3Q9NV31 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IMP3Q9NV31 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IMP3Q9NV31 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IMP3Q9NV31 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IMP3Q9NV31 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IMP3Q9NV31 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IMP3Q9NV31 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IMP3Q9NV31 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IMP3Q9NV31 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IMP3Q9NV31 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IMP3Q9NV31 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms