Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
HELLSQ9NRZ9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HELLSQ9NRZ9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HELLSQ9NRZ9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
HELLSQ9NRZ9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HELLSQ9NRZ9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HELLSQ9NRZ9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HELLSQ9NRZ9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HELLSQ9NRZ9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HELLSQ9NRZ9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HELLSQ9NRZ9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
HELLSQ9NRZ9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HELLSQ9NRZ9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HELLSQ9NRZ9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HELLSQ9NRZ9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HELLSQ9NRZ9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HELLSQ9NRZ9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
HELLSQ9NRZ9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HELLSQ9NRZ9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HELLSQ9NRZ9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HELLSQ9NRZ9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HELLSQ9NRZ9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HELLSQ9NRZ9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HELLSQ9NRZ9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HELLSQ9NRZ9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HELLSQ9NRZ9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HELLSQ9NRZ9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HELLSQ9NRZ9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
HELLSQ9NRZ9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
HELLSQ9NRZ9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HELLSQ9NRZ9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HELLSQ9NRZ9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HELLSQ9NRZ9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HELLSQ9NRZ9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HELLSQ9NRZ9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms