Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E9

C8orf33, UPF0488 protein C8orf33, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf33Q9H7E9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C8orf33Q9H7E9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C8orf33Q9H7E9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C8orf33Q9H7E9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C8orf33Q9H7E9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C8orf33Q9H7E9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C8orf33Q9H7E9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C8orf33Q9H7E9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C8orf33Q9H7E9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C8orf33Q9H7E9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C8orf33Q9H7E9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C8orf33Q9H7E9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C8orf33Q9H7E9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8orf33Q9H7E9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8orf33Q9H7E9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8orf33Q9H7E9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8orf33Q9H7E9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C8orf33Q9H7E9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C8orf33Q9H7E9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C8orf33Q9H7E9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
C8orf33Q9H7E9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C8orf33Q9H7E9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C8orf33Q9H7E9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8orf33Q9H7E9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8orf33Q9H7E9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8orf33Q9H7E9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8orf33Q9H7E9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C8orf33Q9H7E9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8orf33Q9H7E9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8orf33Q9H7E9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8orf33Q9H7E9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8orf33Q9H7E9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C8orf33Q9H7E9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C8orf33Q9H7E9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C8orf33Q9H7E9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C8orf33Q9H7E9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C8orf33Q9H7E9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
C8orf33Q9H7E9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C8orf33Q9H7E9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
C8orf33Q9H7E9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C8orf33Q9H7E9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
C8orf33Q9H7E9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
C8orf33Q9H7E9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
C8orf33Q9H7E9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C8orf33Q9H7E9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C8orf33Q9H7E9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C8orf33Q9H7E9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C8orf33Q9H7E9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C8orf33Q9H7E9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C8orf33Q9H7E9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C8orf33Q9H7E9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C8orf33Q9H7E9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C8orf33Q9H7E9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C8orf33Q9H7E9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C8orf33Q9H7E9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C8orf33Q9H7E9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C8orf33Q9H7E9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C8orf33Q9H7E9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C8orf33Q9H7E9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C8orf33Q9H7E9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C8orf33Q9H7E9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C8orf33Q9H7E9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C8orf33Q9H7E9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C8orf33Q9H7E9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C8orf33Q9H7E9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C8orf33Q9H7E9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C8orf33Q9H7E9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C8orf33Q9H7E9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C8orf33Q9H7E9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C8orf33Q9H7E9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C8orf33Q9H7E9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C8orf33Q9H7E9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C8orf33Q9H7E9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C8orf33Q9H7E9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C8orf33Q9H7E9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C8orf33Q9H7E9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C8orf33Q9H7E9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C8orf33Q9H7E9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C8orf33Q9H7E9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C8orf33Q9H7E9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms