Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F2

TMEM38A, Trimeric intracellular cation channel type A, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM38AQ9H6F2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM38AQ9H6F2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM38AQ9H6F2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM38AQ9H6F2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM38AQ9H6F2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM38AQ9H6F2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM38AQ9H6F2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM38AQ9H6F2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM38AQ9H6F2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM38AQ9H6F2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM38AQ9H6F2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM38AQ9H6F2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM38AQ9H6F2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM38AQ9H6F2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM38AQ9H6F2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM38AQ9H6F2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM38AQ9H6F2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM38AQ9H6F2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM38AQ9H6F2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM38AQ9H6F2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM38AQ9H6F2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM38AQ9H6F2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM38AQ9H6F2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM38AQ9H6F2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM38AQ9H6F2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM38AQ9H6F2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM38AQ9H6F2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM38AQ9H6F2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM38AQ9H6F2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM38AQ9H6F2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM38AQ9H6F2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM38AQ9H6F2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM38AQ9H6F2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM38AQ9H6F2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM38AQ9H6F2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM38AQ9H6F2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM38AQ9H6F2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM38AQ9H6F2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM38AQ9H6F2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms