Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TAF1DQ9H5J8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TAF1DQ9H5J8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TAF1DQ9H5J8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TAF1DQ9H5J8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TAF1DQ9H5J8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TAF1DQ9H5J8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TAF1DQ9H5J8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TAF1DQ9H5J8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TAF1DQ9H5J8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TAF1DQ9H5J8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TAF1DQ9H5J8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TAF1DQ9H5J8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF1DQ9H5J8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF1DQ9H5J8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF1DQ9H5J8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF1DQ9H5J8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TAF1DQ9H5J8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TAF1DQ9H5J8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TAF1DQ9H5J8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TAF1DQ9H5J8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF1DQ9H5J8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms