Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2X0

CHRD, Chordin, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDQ9H2X0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRDQ9H2X0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRDQ9H2X0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRDQ9H2X0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRDQ9H2X0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRDQ9H2X0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRDQ9H2X0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRDQ9H2X0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRDQ9H2X0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRDQ9H2X0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRDQ9H2X0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRDQ9H2X0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRDQ9H2X0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRDQ9H2X0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRDQ9H2X0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRDQ9H2X0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRDQ9H2X0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRDQ9H2X0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRDQ9H2X0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRDQ9H2X0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRDQ9H2X0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRDQ9H2X0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRDQ9H2X0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRDQ9H2X0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRDQ9H2X0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRDQ9H2X0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRDQ9H2X0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRDQ9H2X0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRDQ9H2X0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRDQ9H2X0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRDQ9H2X0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRDQ9H2X0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRDQ9H2X0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRDQ9H2X0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRDQ9H2X0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRDQ9H2X0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHRDQ9H2X0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHRDQ9H2X0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRDQ9H2X0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHRDQ9H2X0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHRDQ9H2X0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRDQ9H2X0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRDQ9H2X0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRDQ9H2X0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRDQ9H2X0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRDQ9H2X0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRDQ9H2X0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRDQ9H2X0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRDQ9H2X0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRDQ9H2X0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRDQ9H2X0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRDQ9H2X0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRDQ9H2X0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms