Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZB8

CPEB1, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1Q9BZB8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPEB1Q9BZB8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPEB1Q9BZB8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPEB1Q9BZB8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms