Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE9

CDHR2, Cadherin-related family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR2Q9BYE9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CDHR2Q9BYE9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CDHR2Q9BYE9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDHR2Q9BYE9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDHR2Q9BYE9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDHR2Q9BYE9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDHR2Q9BYE9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDHR2Q9BYE9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDHR2Q9BYE9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDHR2Q9BYE9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDHR2Q9BYE9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDHR2Q9BYE9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDHR2Q9BYE9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDHR2Q9BYE9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDHR2Q9BYE9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDHR2Q9BYE9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDHR2Q9BYE9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDHR2Q9BYE9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDHR2Q9BYE9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDHR2Q9BYE9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDHR2Q9BYE9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDHR2Q9BYE9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDHR2Q9BYE9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDHR2Q9BYE9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDHR2Q9BYE9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDHR2Q9BYE9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDHR2Q9BYE9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDHR2Q9BYE9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDHR2Q9BYE9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDHR2Q9BYE9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDHR2Q9BYE9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDHR2Q9BYE9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDHR2Q9BYE9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDHR2Q9BYE9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDHR2Q9BYE9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDHR2Q9BYE9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDHR2Q9BYE9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CDHR2Q9BYE9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CDHR2Q9BYE9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CDHR2Q9BYE9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CDHR2Q9BYE9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CDHR2Q9BYE9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDHR2Q9BYE9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDHR2Q9BYE9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDHR2Q9BYE9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDHR2Q9BYE9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDHR2Q9BYE9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDHR2Q9BYE9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDHR2Q9BYE9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDHR2Q9BYE9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDHR2Q9BYE9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDHR2Q9BYE9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CDHR2Q9BYE9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDHR2Q9BYE9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDHR2Q9BYE9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDHR2Q9BYE9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDHR2Q9BYE9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDHR2Q9BYE9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDHR2Q9BYE9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDHR2Q9BYE9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDHR2Q9BYE9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDHR2Q9BYE9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CDHR2Q9BYE9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDHR2Q9BYE9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDHR2Q9BYE9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDHR2Q9BYE9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDHR2Q9BYE9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDHR2Q9BYE9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDHR2Q9BYE9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDHR2Q9BYE9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDHR2Q9BYE9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDHR2Q9BYE9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDHR2Q9BYE9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDHR2Q9BYE9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDHR2Q9BYE9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDHR2Q9BYE9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDHR2Q9BYE9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDHR2Q9BYE9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDHR2Q9BYE9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDHR2Q9BYE9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDHR2Q9BYE9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDHR2Q9BYE9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDHR2Q9BYE9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDHR2Q9BYE9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDHR2Q9BYE9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDHR2Q9BYE9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDHR2Q9BYE9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDHR2Q9BYE9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDHR2Q9BYE9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDHR2Q9BYE9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDHR2Q9BYE9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CDHR2Q9BYE9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDHR2Q9BYE9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDHR2Q9BYE9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDHR2Q9BYE9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDHR2Q9BYE9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDHR2Q9BYE9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDHR2Q9BYE9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CDHR2Q9BYE9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDHR2Q9BYE9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms