Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SYCP2Q9BX26 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SYCP2Q9BX26 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
SYCP2Q9BX26 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SYCP2Q9BX26 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SYCP2Q9BX26 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SYCP2Q9BX26 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SYCP2Q9BX26 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SYCP2Q9BX26 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SYCP2Q9BX26 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SYCP2Q9BX26 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SYCP2Q9BX26 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SYCP2Q9BX26 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SYCP2Q9BX26 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SYCP2Q9BX26 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SYCP2Q9BX26 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SYCP2Q9BX26 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SYCP2Q9BX26 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SYCP2Q9BX26 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
SYCP2Q9BX26 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SYCP2Q9BX26 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SYCP2Q9BX26 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SYCP2Q9BX26 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
SYCP2Q9BX26 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SYCP2Q9BX26 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SYCP2Q9BX26 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.22
SYCP2Q9BX26 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
SYCP2Q9BX26 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SYCP2Q9BX26 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SYCP2Q9BX26 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SYCP2Q9BX26 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SYCP2Q9BX26 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SYCP2Q9BX26 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SYCP2Q9BX26 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SYCP2Q9BX26 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
SYCP2Q9BX26 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SYCP2Q9BX26 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SYCP2Q9BX26 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SYCP2Q9BX26 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SYCP2Q9BX26 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SYCP2Q9BX26 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SYCP2Q9BX26 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SYCP2Q9BX26 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SYCP2Q9BX26 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SYCP2Q9BX26 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
SYCP2Q9BX26 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SYCP2Q9BX26 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SYCP2Q9BX26 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SYCP2Q9BX26 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SYCP2Q9BX26 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
SYCP2Q9BX26 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SYCP2Q9BX26 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SYCP2Q9BX26 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
SYCP2Q9BX26 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
SYCP2Q9BX26 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
SYCP2Q9BX26 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
SYCP2Q9BX26 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
SYCP2Q9BX26 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
SYCP2Q9BX26 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms