Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM7Q9BQ49 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM7Q9BQ49 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms