Protein–RNA interactions for Protein: Q99741

CDC6, Cell division control protein 6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC6Q99741 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDC6Q99741 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC6Q99741 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms