Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CICQ96RK0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CICQ96RK0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CICQ96RK0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CICQ96RK0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CICQ96RK0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CICQ96RK0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CICQ96RK0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CICQ96RK0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CICQ96RK0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CICQ96RK0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CICQ96RK0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CICQ96RK0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CICQ96RK0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CICQ96RK0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CICQ96RK0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CICQ96RK0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CICQ96RK0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CICQ96RK0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CICQ96RK0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CICQ96RK0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CICQ96RK0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CICQ96RK0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CICQ96RK0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CICQ96RK0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CICQ96RK0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CICQ96RK0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CICQ96RK0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CICQ96RK0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CICQ96RK0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CICQ96RK0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms