Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC38A2Q96QD8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms