Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN8

TSSK3, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK3Q96PN8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSSK3Q96PN8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSSK3Q96PN8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSSK3Q96PN8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms