Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAMD11Q96NU1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SAMD11Q96NU1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SAMD11Q96NU1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms