Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C8orf49Q96NF6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C8orf49Q96NF6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms