Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ALPK3Q96L96 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ALPK3Q96L96 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ALPK3Q96L96 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ALPK3Q96L96 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALPK3Q96L96 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALPK3Q96L96 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALPK3Q96L96 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALPK3Q96L96 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALPK3Q96L96 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALPK3Q96L96 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALPK3Q96L96 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALPK3Q96L96 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALPK3Q96L96 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ALPK3Q96L96 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALPK3Q96L96 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALPK3Q96L96 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALPK3Q96L96 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALPK3Q96L96 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALPK3Q96L96 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALPK3Q96L96 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALPK3Q96L96 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ALPK3Q96L96 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALPK3Q96L96 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ALPK3Q96L96 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALPK3Q96L96 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALPK3Q96L96 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALPK3Q96L96 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALPK3Q96L96 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALPK3Q96L96 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALPK3Q96L96 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ALPK3Q96L96 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ALPK3Q96L96 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALPK3Q96L96 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALPK3Q96L96 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALPK3Q96L96 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALPK3Q96L96 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALPK3Q96L96 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ALPK3Q96L96 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALPK3Q96L96 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALPK3Q96L96 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms