Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EME1Q96AY2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EME1Q96AY2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EME1Q96AY2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EME1Q96AY2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EME1Q96AY2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EME1Q96AY2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EME1Q96AY2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
EME1Q96AY2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EME1Q96AY2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms