Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BHMTQ93088 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BHMTQ93088 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BHMTQ93088 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms