Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BEST2Q8NFU1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BEST2Q8NFU1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms