Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHDC9Q8NEP7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHDC9Q8NEP7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms