Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z569

BRAP, BRCA1-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAPQ7Z569 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
BRAPQ7Z569 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRAPQ7Z569 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms