Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z2

RD3, Protein RD3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3Q7Z3Z2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RD3Q7Z3Z2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RD3Q7Z3Z2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RD3Q7Z3Z2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RD3Q7Z3Z2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RD3Q7Z3Z2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RD3Q7Z3Z2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RD3Q7Z3Z2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RD3Q7Z3Z2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RD3Q7Z3Z2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RD3Q7Z3Z2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RD3Q7Z3Z2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RD3Q7Z3Z2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RD3Q7Z3Z2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RD3Q7Z3Z2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RD3Q7Z3Z2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RD3Q7Z3Z2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RD3Q7Z3Z2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RD3Q7Z3Z2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RD3Q7Z3Z2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RD3Q7Z3Z2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RD3Q7Z3Z2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RD3Q7Z3Z2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RD3Q7Z3Z2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RD3Q7Z3Z2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RD3Q7Z3Z2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RD3Q7Z3Z2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms