Protein–RNA interactions for Protein: Q717R9

CYS1, Cystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYS1Q717R9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYS1Q717R9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYS1Q717R9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYS1Q717R9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms