Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SRCAPQ6ZRS2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SRCAPQ6ZRS2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SRCAPQ6ZRS2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SRCAPQ6ZRS2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SRCAPQ6ZRS2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SRCAPQ6ZRS2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SRCAPQ6ZRS2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SRCAPQ6ZRS2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SRCAPQ6ZRS2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SRCAPQ6ZRS2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
SRCAPQ6ZRS2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
SRCAPQ6ZRS2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SRCAPQ6ZRS2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SRCAPQ6ZRS2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SRCAPQ6ZRS2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SRCAPQ6ZRS2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SRCAPQ6ZRS2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SRCAPQ6ZRS2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SRCAPQ6ZRS2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SRCAPQ6ZRS2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SRCAPQ6ZRS2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SRCAPQ6ZRS2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SRCAPQ6ZRS2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SRCAPQ6ZRS2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SRCAPQ6ZRS2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SRCAPQ6ZRS2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SRCAPQ6ZRS2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SRCAPQ6ZRS2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SRCAPQ6ZRS2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SRCAPQ6ZRS2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SRCAPQ6ZRS2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SRCAPQ6ZRS2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SRCAPQ6ZRS2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SRCAPQ6ZRS2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SRCAPQ6ZRS2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SRCAPQ6ZRS2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
SRCAPQ6ZRS2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SRCAPQ6ZRS2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SRCAPQ6ZRS2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SRCAPQ6ZRS2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SRCAPQ6ZRS2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SRCAPQ6ZRS2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SRCAPQ6ZRS2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SRCAPQ6ZRS2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SRCAPQ6ZRS2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SRCAPQ6ZRS2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SRCAPQ6ZRS2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SRCAPQ6ZRS2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SRCAPQ6ZRS2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SRCAPQ6ZRS2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SRCAPQ6ZRS2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SRCAPQ6ZRS2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SRCAPQ6ZRS2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SRCAPQ6ZRS2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SRCAPQ6ZRS2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SRCAPQ6ZRS2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SRCAPQ6ZRS2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SRCAPQ6ZRS2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SRCAPQ6ZRS2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SRCAPQ6ZRS2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SRCAPQ6ZRS2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SRCAPQ6ZRS2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms