Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CCDC141Q6ZP82 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CCDC141Q6ZP82 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CCDC141Q6ZP82 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CCDC141Q6ZP82 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
CCDC141Q6ZP82 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CCDC141Q6ZP82 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CCDC141Q6ZP82 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC141Q6ZP82 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC141Q6ZP82 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC141Q6ZP82 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CCDC141Q6ZP82 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC141Q6ZP82 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC141Q6ZP82 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC141Q6ZP82 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CCDC141Q6ZP82 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC141Q6ZP82 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC141Q6ZP82 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC141Q6ZP82 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC141Q6ZP82 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC141Q6ZP82 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC141Q6ZP82 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC141Q6ZP82 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC141Q6ZP82 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
CCDC141Q6ZP82 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC141Q6ZP82 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CCDC141Q6ZP82 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CCDC141Q6ZP82 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CCDC141Q6ZP82 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CCDC141Q6ZP82 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CCDC141Q6ZP82 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms