Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GBP6Q6ZN66 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms