Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC174Q6PII3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC174Q6PII3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC174Q6PII3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC174Q6PII3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC174Q6PII3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC174Q6PII3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC174Q6PII3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC174Q6PII3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC174Q6PII3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC174Q6PII3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC174Q6PII3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC174Q6PII3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC174Q6PII3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC174Q6PII3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC174Q6PII3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC174Q6PII3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC174Q6PII3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC174Q6PII3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC174Q6PII3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms