Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GARNL3Q5VVW2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GARNL3Q5VVW2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms