Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
C1orf53Q5VUE5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
C1orf53Q5VUE5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms