Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HIVEP3Q5T1R4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HIVEP3Q5T1R4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms