Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
FRMPD1Q5SYB0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
FRMPD1Q5SYB0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
FRMPD1Q5SYB0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
FRMPD1Q5SYB0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
FRMPD1Q5SYB0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
FRMPD1Q5SYB0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
FRMPD1Q5SYB0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
FRMPD1Q5SYB0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
FRMPD1Q5SYB0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
FRMPD1Q5SYB0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
FRMPD1Q5SYB0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
FRMPD1Q5SYB0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
FRMPD1Q5SYB0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
FRMPD1Q5SYB0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
FRMPD1Q5SYB0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
FRMPD1Q5SYB0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
FRMPD1Q5SYB0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
FRMPD1Q5SYB0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
FRMPD1Q5SYB0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
FRMPD1Q5SYB0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
FRMPD1Q5SYB0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
FRMPD1Q5SYB0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
FRMPD1Q5SYB0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
FRMPD1Q5SYB0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
FRMPD1Q5SYB0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
FRMPD1Q5SYB0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
FRMPD1Q5SYB0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
FRMPD1Q5SYB0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
FRMPD1Q5SYB0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
FRMPD1Q5SYB0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC35.25■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
FRMPD1Q5SYB0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
FRMPD1Q5SYB0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
FRMPD1Q5SYB0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
FRMPD1Q5SYB0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
FRMPD1Q5SYB0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
FRMPD1Q5SYB0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
FRMPD1Q5SYB0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC35.18■■■■□ 3.22
FRMPD1Q5SYB0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
FRMPD1Q5SYB0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
FRMPD1Q5SYB0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
FRMPD1Q5SYB0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
FRMPD1Q5SYB0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
FRMPD1Q5SYB0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
FRMPD1Q5SYB0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
FRMPD1Q5SYB0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
FRMPD1Q5SYB0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
FRMPD1Q5SYB0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms