Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM2

SNAPC4, snRNA-activating protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC4Q5SXM2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
SNAPC4Q5SXM2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
SNAPC4Q5SXM2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
SNAPC4Q5SXM2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
SNAPC4Q5SXM2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
SNAPC4Q5SXM2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
SNAPC4Q5SXM2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
SNAPC4Q5SXM2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
SNAPC4Q5SXM2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
SNAPC4Q5SXM2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
SNAPC4Q5SXM2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
SNAPC4Q5SXM2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
SNAPC4Q5SXM2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
SNAPC4Q5SXM2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
SNAPC4Q5SXM2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
SNAPC4Q5SXM2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
SNAPC4Q5SXM2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
SNAPC4Q5SXM2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.75
SNAPC4Q5SXM2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
SNAPC4Q5SXM2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
SNAPC4Q5SXM2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
SNAPC4Q5SXM2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
SNAPC4Q5SXM2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
SNAPC4Q5SXM2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
SNAPC4Q5SXM2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
SNAPC4Q5SXM2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
SNAPC4Q5SXM2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
SNAPC4Q5SXM2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
SNAPC4Q5SXM2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
SNAPC4Q5SXM2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
SNAPC4Q5SXM2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
SNAPC4Q5SXM2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
SNAPC4Q5SXM2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
SNAPC4Q5SXM2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
SNAPC4Q5SXM2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
SNAPC4Q5SXM2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
SNAPC4Q5SXM2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
SNAPC4Q5SXM2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC38.47■■■■□ 3.75
SNAPC4Q5SXM2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
SNAPC4Q5SXM2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
SNAPC4Q5SXM2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
SNAPC4Q5SXM2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
SNAPC4Q5SXM2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.46■■■■□ 3.75
SNAPC4Q5SXM2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
SNAPC4Q5SXM2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
SNAPC4Q5SXM2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
SNAPC4Q5SXM2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC38.45■■■■□ 3.75
SNAPC4Q5SXM2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
SNAPC4Q5SXM2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
SNAPC4Q5SXM2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
SNAPC4Q5SXM2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
SNAPC4Q5SXM2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
SNAPC4Q5SXM2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
SNAPC4Q5SXM2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC38.45■■■■□ 3.75
SNAPC4Q5SXM2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
SNAPC4Q5SXM2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
SNAPC4Q5SXM2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
SNAPC4Q5SXM2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
SNAPC4Q5SXM2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
SNAPC4Q5SXM2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
SNAPC4Q5SXM2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
SNAPC4Q5SXM2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
SNAPC4Q5SXM2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
SNAPC4Q5SXM2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
SNAPC4Q5SXM2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
SNAPC4Q5SXM2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
SNAPC4Q5SXM2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
SNAPC4Q5SXM2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
SNAPC4Q5SXM2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
SNAPC4Q5SXM2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
SNAPC4Q5SXM2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
SNAPC4Q5SXM2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
SNAPC4Q5SXM2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
SNAPC4Q5SXM2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SNAPC4Q5SXM2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SNAPC4Q5SXM2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SNAPC4Q5SXM2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SNAPC4Q5SXM2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
SNAPC4Q5SXM2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC38.4■■■■□ 3.74
SNAPC4Q5SXM2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
SNAPC4Q5SXM2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
SNAPC4Q5SXM2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
SNAPC4Q5SXM2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC38.39■■■■□ 3.74
SNAPC4Q5SXM2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
SNAPC4Q5SXM2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
SNAPC4Q5SXM2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
SNAPC4Q5SXM2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
SNAPC4Q5SXM2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
SNAPC4Q5SXM2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
SNAPC4Q5SXM2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
SNAPC4Q5SXM2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
SNAPC4Q5SXM2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
SNAPC4Q5SXM2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
SNAPC4Q5SXM2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
SNAPC4Q5SXM2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
SNAPC4Q5SXM2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
SNAPC4Q5SXM2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
SNAPC4Q5SXM2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
SNAPC4Q5SXM2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
SNAPC4Q5SXM2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms