Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPL39P5Q59GN2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL39P5Q59GN2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms