Protein–RNA interactions for Protein: Q496J9

SV2C, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2CQ496J9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SV2CQ496J9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SV2CQ496J9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SV2CQ496J9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms