Protein–RNA interactions for Protein: Q31612

HLA-B, HLA class I histocompatibility antigen, B-73 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-BQ31612 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-BQ31612 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms