Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERCC6LQ2NKX8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERCC6LQ2NKX8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 851.6 ms