Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CSPP1Q1MSJ5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSPP1Q1MSJ5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSPP1Q1MSJ5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.7 ms