Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IRF4Q15306 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF4Q15306 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
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