Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ODF1Q14990 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ODF1Q14990 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms