Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TNFAIP1Q13829 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TNFAIP1Q13829 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.57■■■□□ 2
TNFAIP1Q13829 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TNFAIP1Q13829 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TNFAIP1Q13829 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNFAIP1Q13829 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TNFAIP1Q13829 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TNFAIP1Q13829 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNFAIP1Q13829 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNFAIP1Q13829 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TNFAIP1Q13829 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
TNFAIP1Q13829 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TNFAIP1Q13829 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TNFAIP1Q13829 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNFAIP1Q13829 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNFAIP1Q13829 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TNFAIP1Q13829 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TNFAIP1Q13829 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNFAIP1Q13829 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TNFAIP1Q13829 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TNFAIP1Q13829 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
TNFAIP1Q13829 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TNFAIP1Q13829 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNFAIP1Q13829 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNFAIP1Q13829 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNFAIP1Q13829 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNFAIP1Q13829 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TNFAIP1Q13829 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNFAIP1Q13829 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNFAIP1Q13829 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TNFAIP1Q13829 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TNFAIP1Q13829 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TNFAIP1Q13829 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TNFAIP1Q13829 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNFAIP1Q13829 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TNFAIP1Q13829 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNFAIP1Q13829 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNFAIP1Q13829 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNFAIP1Q13829 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNFAIP1Q13829 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNFAIP1Q13829 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNFAIP1Q13829 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNFAIP1Q13829 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNFAIP1Q13829 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNFAIP1Q13829 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNFAIP1Q13829 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNFAIP1Q13829 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TNFAIP1Q13829 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNFAIP1Q13829 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNFAIP1Q13829 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNFAIP1Q13829 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNFAIP1Q13829 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNFAIP1Q13829 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNFAIP1Q13829 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNFAIP1Q13829 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TNFAIP1Q13829 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNFAIP1Q13829 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNFAIP1Q13829 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNFAIP1Q13829 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNFAIP1Q13829 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNFAIP1Q13829 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNFAIP1Q13829 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNFAIP1Q13829 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNFAIP1Q13829 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNFAIP1Q13829 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNFAIP1Q13829 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNFAIP1Q13829 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNFAIP1Q13829 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNFAIP1Q13829 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNFAIP1Q13829 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNFAIP1Q13829 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNFAIP1Q13829 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TNFAIP1Q13829 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
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