Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CUL4BQ13620 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUL4BQ13620 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUL4BQ13620 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUL4BQ13620 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CUL4BQ13620 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUL4BQ13620 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUL4BQ13620 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CUL4BQ13620 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CUL4BQ13620 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CUL4BQ13620 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CUL4BQ13620 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CUL4BQ13620 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUL4BQ13620 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUL4BQ13620 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUL4BQ13620 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUL4BQ13620 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUL4BQ13620 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUL4BQ13620 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUL4BQ13620 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUL4BQ13620 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUL4BQ13620 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CUL4BQ13620 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUL4BQ13620 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUL4BQ13620 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CUL4BQ13620 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CUL4BQ13620 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CUL4BQ13620 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CUL4BQ13620 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CUL4BQ13620 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CUL4BQ13620 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CUL4BQ13620 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CUL4BQ13620 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CUL4BQ13620 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CUL4BQ13620 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUL4BQ13620 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUL4BQ13620 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUL4BQ13620 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUL4BQ13620 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUL4BQ13620 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUL4BQ13620 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
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