Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFFO1Q0D2I5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFFO1Q0D2I5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms