Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNX1T1Q06455 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RUNX1T1Q06455 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms