Protein–RNA interactions for Protein: Q06410

ATG17, Autophagy-related protein 17, yeastyeast

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG17Q06410 YCL012CYCL012C 405 nt4.97□□□□□ -1.61
ATG17Q06410 MBP1YDL056W 2502 nt4.97□□□□□ -1.61
ATG17Q06410 GIP2YER054C 1647 nt4.97□□□□□ -1.61
ATG17Q06410 UTR4YEL038W 684 nt4.96□□□□□ -1.62
ATG17Q06410 SPL2YHR136C 447 nt4.96□□□□□ -1.62
ATG17Q06410 ETT1YOR051C 1239 nt4.96□□□□□ -1.62
ATG17Q06410 MET31YPL038W 534 nt4.96□□□□□ -1.62
ATG17Q06410 VHC1YBR235W 3363 nt4.95□□□□□ -1.62
ATG17Q06410 SLC1YDL052C 912 nt4.95□□□□□ -1.62
ATG17Q06410 TGS1YPL157W 948 nt4.95□□□□□ -1.62
ATG17Q06410 PMA1YGL008C 2757 nt4.94□□□□□ -1.62
ATG17Q06410 FHL1YPR104C 2811 nt4.94□□□□□ -1.62
ATG17Q06410 FYV1YDR024W 486 nt4.94□□□□□ -1.62
ATG17Q06410 YEL045CYEL045C 426 nt4.94□□□□□ -1.62
ATG17Q06410 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt4.94□□□□□ -1.62
ATG17Q06410 RPL21BYPL079W 483 nt4.94□□□□□ -1.62
ATG17Q06410 MRI1YPR118W 1236 nt4.94□□□□□ -1.62
ATG17Q06410 ATG12YBR217W 561 nt4.94□□□□□ -1.62
ATG17Q06410 NDC1YML031W 1968 nt4.94□□□□□ -1.62
ATG17Q06410 PRR1YKL116C 1557 nt4.94□□□□□ -1.62
ATG17Q06410 STP4YDL048C 1473 nt4.94□□□□□ -1.62
ATG17Q06410 SHM1YBR263W 1473 nt4.94□□□□□ -1.62
ATG17Q06410 MSS116YDR194C 1995 nt4.93□□□□□ -1.62
ATG17Q06410 NUP116YMR047C 3342 nt4.93□□□□□ -1.62
ATG17Q06410 YEL067CYEL067C 588 nt4.93□□□□□ -1.62
ATG17Q06410 SEG2YKL105C 3399 nt4.93□□□□□ -1.62
ATG17Q06410 SEC13YLR208W 894 nt4.93□□□□□ -1.62
ATG17Q06410 ETR1YBR026C 1143 nt4.93□□□□□ -1.62
ATG17Q06410 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt4.93□□□□□ -1.62
ATG17Q06410 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt4.92□□□□□ -1.62
ATG17Q06410 ZRT2YLR130C 1269 nt4.92□□□□□ -1.62
ATG17Q06410 PIN2YOR104W 849 nt4.92□□□□□ -1.62
ATG17Q06410 ZUO1YGR285C 1302 nt4.92□□□□□ -1.62
ATG17Q06410 TFB3YDR460W 966 nt4.91□□□□□ -1.62
ATG17Q06410 RPL34AYER056C-A 366 nt4.91□□□□□ -1.62
ATG17Q06410 MOG1YJR074W 657 nt4.91□□□□□ -1.62
ATG17Q06410 YMR245WYMR245W 621 nt4.91□□□□□ -1.62
ATG17Q06410 NPT1YOR209C 1290 nt4.91□□□□□ -1.62
ATG17Q06410 TRS23YDR246W 660 nt4.9□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 YLR184WYLR184W 348 nt4.9□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 CSR1YLR380W 1227 nt4.9□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 MOT2YER068W 1764 nt4.9□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 MPS3YJL019W 2049 nt4.9□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 GCN20YFR009W 2259 nt4.9□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 DOA1YKL213C 2148 nt4.9□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 IPK1YDR315C 846 nt4.89□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 YDR417CYDR417C 372 nt4.89□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 TRX2YGR209C 315 nt4.89□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 SCW4YGR279C 1161 nt4.89□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 PAN6YIL145C 930 nt4.89□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 FZO1YBR179C 2568 nt4.89□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 KRS1YDR037W 1776 nt4.88□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 MRK1YDL079C 1506 nt4.88□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 MNN11YJL183W 1269 nt4.88□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 CPR6YLR216C 1116 nt4.88□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 IMD1YAR073W 1212 nt4.88□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 MAP2YBL091C 1266 nt4.88□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 DCC1YCL016C 1143 nt4.88□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 NUP1YOR098C 3231 nt4.88□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 HOT1YMR172W 2160 nt4.88□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 SAP155YFR040W 3009 nt4.88□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 MNS1YJR131W 1650 nt4.87□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt4.87□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 SRG1SRG1 551 nt4.87□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 NAG1YGR031C-A 492 nt4.87□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 NIT2YJL126W 924 nt4.87□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 KTI12YKL110C 942 nt4.87□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 SCW10YMR305C 1170 nt4.87□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 TUB3YML124C 1338 nt4.87□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 GAL4YPL248C 2646 nt4.87□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 MDR1YGR100W 2853 nt4.86□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 FUI1YBL042C 1920 nt4.86□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 FRE1YLR214W 2061 nt4.86□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 COX26YDR119W-A 201 nt4.86□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 YDR154CYDR154C 351 nt4.86□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt4.86□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt4.86□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt4.86□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt4.86□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt4.86□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt4.86□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt4.86□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt4.86□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt4.86□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt4.86□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 YHL049CYHL049C 816 nt4.86□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 MEC3YLR288C 1425 nt4.86□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 CLA4YNL298W 2529 nt4.86□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 YTA12YMR089C 2478 nt4.85□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 GAL83YER027C 1254 nt4.85□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 YGR016WYGR016W 573 nt4.85□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 ENV7YPL236C 1095 nt4.85□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 BRL1YHR036W 1416 nt4.85□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 YEF1YEL041W 1488 nt4.85□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 HXT7YDR342C 1713 nt4.84□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 HXT6YDR343C 1713 nt4.84□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 BUD22YMR014W 1560 nt4.84□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 IWR1YDL115C 1062 nt4.84□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 YKL023WYKL023W 834 nt4.84□□□□□ -1.63
ATG17Q06410 TLG2YOL018C 1194 nt4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.4 ms