Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSBP1Q04837 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSBP1Q04837 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms